Stéphane Aulagnier (Professeur Université Paul Sabatier)

Formation

• 1981 -    Thèse de Doctorat de troisième cycle de Biologie cellulaire et Biologie appliquée (option Biométrie) - Université Claude Bernard, Lyon I
• 1992 -    Thèse de Doctorat d'Etat es Sciences Naturelles - Université des Sciences et Techniques du Languedoc, Montpellier II

Activités

Co-responsable de la mention Biodiversité, Ecologie, Evolution et responsable du parcours Man & Biosphère.

Enseignement : Biologie de la Conservation, Pratique de Gestion de la Biodiversité, Pratiques de communication.

Expert depuis 1995 auprès du Ministère en charge de l'écologie dans le cadre de l'Accord sur la Protection des populations de Chiroptères d'Europe (Eurobats).

Editeur associé des revues "Mammalia", "Ecoscience". Editeur de la revue "Arvicola".

Membre du conseil scientifique du Parc National des Pyrénées, du Conservatoire des Espaces Naturels de Midi-Pyrénées.

Recherche : formation de jeunes chercheurs, notamment de pays en émergence, et de professionnels qui souhaitent valoriser leur activité par un diploma. En réponse à la demande sociétale, mes travaux s'orientent vers la Biologie de la Conservation, plus particulièrement l'étude d'espèces menacées telles le Vison d'Europe (Mustela lutreola), les Chiroptères et, plus récemment, le Desman des Pyrénées (Galemys pyrenaicus) et les ongulés d’Algérie (Gazella cuvieri et Ammotragus lervia). La connaissance de l'utilisation de l'habitat ou le maintien de variabilité adaptative conditionnent la réussite des programmes de restauration des populations. Cette variabilité peut être évaluée à travers la morphométrie, la génétique, le comportement,... Ces recherches nécessitent une analyse intégrative en adéquation avec les compétences acquises au cours de ces dernières années.

Publications

• Aulagnier S., Haffner P., Mitchell-Jones T., Moutou F. & Zima J., 2010. Guide des Mammifères d’Europe, d’Afrique du Nord et du Proche Orient. Delachaux & Niestlé, Paris, 272p (traduit en anglais, allemand, espagnol, italien).
• Aulagnier S., 2010. 5.2 France. in : J. Battersby (comp.) : Guidelines for surveillance and monitoring of European bats. Eurobats Publ. Ser., 5 : 64-72.
• Brahmi K., Kkechekhouche E., Mostefaoui O., Bebba K., Hadjoudj M., Doumandji S., Baziz B. & Aulagnier S., 2010. Extralimital presence of small mammals in north-eastern Algeria. Mammalia, 74(1) : 105-108.
• Cap H., Deleporte P., Joachim J., Aulagnier S., Nicolas V., Legal L. & Reby D., 2010 Comportements vocaux et phylogénie des Cervidés. Biosystema, 27 : 27-44.
• Khammes-El Homsi N. & Aulagnier S., 2010. Unexpected morphometric differentiation of the Algerian mouse, Mus spretus (Rodentia : Muridae), from Kabylie of Djurdjura (Algeria). Mammalia, 74(2) : 199-207.
• Moinet M., Fournier-Chambrillon C., André-Fontaine G., Aulagnier S., Mesplede A., Blanchard B., Descarsin V., Dumas P., Dumas Y., Coic C., Couzi L. & Fournier P., 2010. Leptospirosis in free-ranging endangered European mink (Mustela lutreola) and other small Carnivores (Mustelidae, Viverridae) from southwestern France. J. Wildl. Dis., 46(4) : 1141-1151.
• Dalhoumi R., Aissa P. & Aulagnier S., 2011. Taxonomie et répartition des Chiroptères de Tunisie. Rev. suisse Zool., 118(2) : 265-292.
• Pécheur L., Fournier P., Laoué E., Mouton E., Viélet C. & Aulagnier S., 2011. Application de la méthodologie de Harrington à l'identification des empreintes de Vison d'Amérique (Mustela vison), de Putois d'Europe (M. putorius) et de Vison d'Europe (M. lutreola) dans le sud-ouest de la France. Arvicola, 20(1) : 6-10
• Vincent S., Némoz M. & Aulagnier S., 2011. Activity and foraging habitats of Miniopterus schreibersii (Chiroptera, Miniopteridae) in southern France : implications for its conservation. Hystrix It. J. Mammal., (n.s.) 22(1) : 57-72.
• Abbas F., Morellet N., Hewison A.J.M., Merlet J., Cargnelutti B., Lourtet B., Angibault J.M., Daufresne T., Aulagnier S. & Verheyden H., 2011. Landscape fragmentation generates spatial variation of diet composition and quality in a generalist herbivore. Oecologia, 167(2) : 401-411.
• Abbas F., Merlet J., Morellet N., Verheyden H., Hewison A.J.M. Cargnelutti B., Angibault J.M., Picot D., Rames J.L., Lourtet B., Aulagnier S. & Daufresne T., 2012. Roe deer may markedly alter forest nitrogen and phosphorus budgets across Europe. Oikos, 121(8) : 1271-1278.
• Aulagnier S., 2012. Introduction. Analyse biogéographique du peuplement de micromammifères. Campagnol fouisseur. Campagnol souterrain. Campagnol des Pyrénées. Campagnol basque. Campagnol provençal. Souris d'Afrique du Nord. in : E. Jacquot (coord.) : Atlas des Mammifères sauvages de Midi-Pyrénées. 4 - Erinacéomorphes, Soricomorphes et Rongeurs. Nature Midi-Pyrénées, Toulouse.
• Aulagnier S., 2012. Cent ans déjà, l’héritage de Gerrit S. Miller pour les Pyrénées et Midi-Pyrénées. Bull. Soc. Hist. nat. Toulouse, 148 : 59-66.
• Barataud, M., & Aulagnier, S., 2012. Pourquoi certaines espèces de chauves-souris s'associent-elles en essaims mixtes durant la mise bas et l'élevage des jeunes ? Exemple en Limousin. Arvicola, 20(2) : 40-42.
• Brahmi K., Aulagnier S., Slimani S., Mann C.S., Doumandji S. & Baziz B., 2012. Diet of the Greater white-toothed shrew Crocidura russula (Mammalia: Soricidae) in Grande Kabylie (Algeria). Ital. J. Zool., 79(2) : 239-245.
• Brahmi K., Khechekhouche E., Mostefaoui O., Doumandji S., Baziz B. & Aulagnier S., 2012. First quantitative data on the diet of the Fennec fox, Vulpes zerda (Canidae, Carnivora), in Algeria. Folia Zool., 61(1) : 61-70.
• Abbas F., Picot D., Merlet J., Cargnelutti B., Lourtet B., Angibault J.M., Daufresne T., Aulagnier S. & Verheyden H., 2013. A typical browser, the Roe deer, may consume substantial quantities of grasses in open landscapes. Eur. J. Wildl. Res., 59(1) : 69-75.
• Aulagnier S., 2013. Genus Atlantoxerus. Barbary ground squirrel. Atlantoxerus getulus. Barbary ground squirell. Gerbillus maghrebi. Maghreb gerbil.  in : D.C.D. Happold (ed) : Mammals of Africa. Volume III. Rodents, hares and rabbits. Bloomsbury Publ., London.
• Aulagnier S., 2013. Crocidura russula. Greater shrew (Greater white-toothed shrew). Crocidura tarfayaensis. Saharan shrew (Tarfaya's shrew). Crocidura whitakeri. Whitaker's shrew (Lesser Maghrebi shrew). Suncus etruscus. Etruscan dwarf shrew (Pigmy white-toothed shrew). in : M. Happold & D.C.D. Happold (eds) : Mammals of Africa. Volume IV. Hedgehogs, shrews and bats. Bloomsbury Publ., London.
• Aulagnier S., 2013. Genus Asellia. Trident leaf-nosed bats. Asellia patrizii. Patrizi's trident leaf-nosed bat. Asellia tridens. Geoffroy's trident leaf-nosed bats. Family Rhinopomatidae. Mouse-tailed bats. Genus Rhinopoma. Mouse-tailed bats. Rhinopoma hardwickii. Lesser mouse-tailed bat. Rhinopoma macinnesi. MacInnes's mouse-tailed bat. Rhinopoma microphyllum. Greater mouse-tailed bat. Eptesicus serotinus. Common serotine. Nyctalus leisleri. Leisler's noctule (Leisler's bat). Pipistrellus pipistrellus. Common pipistrelle. Pipistrellus savii. Savi's pipistrelle. Genus Plecotus. Long-eared bats. Plecotus christii. Christie's long-eared bat. Plecotus gaisleri. Gaisler's long-eared bat. Myotis emarginatus. Geoffroy's myotis. Myotis mystacinus. Whiskered myotis (Whiskered bat). Myotis nattereri. Natterer's myotis (Natterer's bat). Pipistrellus hanaki. Hanák's pipistrelle. Myotis capaccinii. Long fingered myotis. in : M. Happold & D.C.D. Happold (eds) : Mammals of Africa. Volume IV. Hedgehogs, shrews and bats. Bloomsbury Publ., London.
• Aulagnier S., Arthur C. & Jacquot E., 2013. Evolution de la richesse mammalogique en Midi-Pyrénées. in : E. Jacquot (coord.) : Atlas des Mammifères sauvages de Midi-Pyrénées. 1 - Mammifères en Midi-Pyrénées. Nature Midi-Pyrénées - Conservatoire des Espaces Naturels de Midi-Pyrénées, Toulouse, 46-55.
• Presetnik P. & Aulagnier S., 2013. The diet of Shreiber's bent-winged bat, Miniopterus schreibersii (Chiroptera : Miniopteridae), in northeastern Slovenia (Central Europe). Mammalia, 77(3) : 297-305.
• Dalhoumi R., Hedfi A., Aissa P. & Aulagnier S., 2014. Bats of Jebel Mghilla National Park (central Tunisia) : first survey and habitat-related activity. Trop. Zool., 27(2) : 53-62.
• Moutou F., Arthur C. & Aulagnier S., 2014. Mammifères et mammalogistes, un siècle de cohabitation. Bourgogne Nat., 20 : 149-154.
• Tillon L. & Aulagnier S., 2014. Tree cavities used as bat roosts in a European temperate lowland sub-Atlantic forest. Acta Chiropterol., 16(2) : 359-368.
• Aulagnier S., Bayed A., Cuzin F. & Thévenot M., 2015. Mammifères du Maroc : extinctions et régressions au cours du XXème siècle. in : Approche intégrative de la 6ème extinction : influence de l’installation des hommes modernes au Maroc sur l’évolution de la biodiversité des petits vertébrés terrestres. Trav. Inst. Sci., Sér. gén., 8 : 53-67.
• Charbonnel A., Buisson L., Biffi M., D'Amico F., Besnard A., Aulagnier S., Blanc F., Gillet F., Lacaze V., Michaux J.R., Némoz M., Page C., Sanchez-Perez J.M., Sauvage S. & Laffaille P., 2015. Integrating hydrological features and genetically validated occurrence data in occupancy modelling of an endemic and endangered semi-aquatic mammal, Galemys pyrenaicus, in a Pyrenean catchment. Biol. Conserv., 184 : 182-192.
• Dalhoumi R., Aissa P. & Aulagnier S., 2015. Cycle annuel d'activité des Chiroptères du Parc National de Bou-Hedma (Tunisie). Rev. Ecol., 70(3) : 261-270.
• Denys C., Nespoulet R., Aulagnier S. & El Hassani A., 2015. Introduction. in : Approche intégrative de la 6ème extinction : influence de l’installation des hommes modernes au Maroc sur l’évolution de la biodiversité des petits vertébrés terrestres. Trav. Inst. Sci., Sér. gén., 8 : 1-4.
• Gillet F., Cabria M.T., Némoz M., Blanc F., Fournier-Chambrillon C., Sourp E., Vial-Novella C., Aulagnier S. & Michaux J.R., 2015. PCR-RFLP identification of the endangered Pyrenean desman, Galemys pyrenaicus (Soricomorpha, Talpidae), based on faecal DNA. Mammalia, 79(4) : 73-77.
• Gillet F., Tiouchichine M.L., Galan M., Blanc F., Némoz M., Aulagnier S. & Michaux J.R., 2015. A new method to identify the endangered Pyrenean desman (Galemys pyrenaicus) and to study its diet, using next generation sequencing from faeces. Mammal. Biol., 80(6) : 505-509.
• Quéméré E., Galan M., Cosson J.F., Klein F., Aulagnier S., Gilot-Fromont E., Merlet J., Bonhomme M., Hewison A.J.M., & Charbonnel N., 2015. Immunogenetic heterogeneity in a widespread ungulate : the European roe deer (Capreolus capreolus). Mol. Ecol., 24(15) : 3873-3887.
• Arias M.C., Aulagnier S. & 158 co-authors, 2016. Microsatellite records for volume 8, issue 1. (Isolation, characterization and PCR multiplexing of polymorphic microsatellite markers in the endangered Pyrenean desman, Galemys pyrenaicus). Conserv. Genet. Resour., 8(1) : 43-81.
• Aulagnier S. & Leclerc N., 2016. Etudier et protéger les Chiroptères : seuls les écrits restent… Symbioses, N.S. 34 : 14-18.
• Aulia Rahman D., Gonzalez G. & Aulagnier S., 2016. Benefit of camera trapping for surveying the critically endangered Bawean deer Axis kuhlii (Temminck, 1836). Trop. Zool., 29(4) : 155-172.
• Bounaceur F., Benamor N., Bissaad F.Z., Abdi A. & Aulagnier S., 2016. Is there a future for the last populations of Aoudad (Ammotragus lervia) in Northern Algeria ? Pakistan J. Zool., 48(6) : 1727-1731.
• Bounaceur F., Boualem A., Benamor N., Fellous A., Benkheira A., Bissaad F.Z. & Aulagnier S., 2016. Updated distribution and local abundance of the endangered Cuvier's gazelle (Mammalia, Bovidae) in Algeria. Folia Zool., 65(3) : 233-238.
• Dalhoumi R., Aissa P. & Aulagnier S., 2016. Seasonal variations of sexual size dimorphism in two Mediterranean bat species from Tunisia : the Kuhl’s pipistrelle (Pipistrellus kuhlii) and the Isabelline serotine (Eptesicus isabellinus). Folia Zool., 65(2) : 157-163.
• Dalhoumi R., Aissa P. & Aulagnier S., 2016. Bat species richness and activity in Bou Hedma National Park (central Tunisia). Turk. J. Zool., 40(6) : 864-875.
• Gillet F., Le Roux B., Blanc F., Bodo F., Fournier-Chambrillon C., Fournier P., Jacob F., Lacaze V., Némoz M., Aulagnier S. & Michaux J.R., 2016. Genetic monitoring of the endangered Pyrenean desman (Galemys pyrenaicus) in the Aude river, France. Belg. J. Zool., 146(1) : 44-52.
• Tillon L., Bresso K. & Aulagnier S., 2016. Tree selection by roosting bats in a European temperate lowland sub-Atlantic forest. Mammalia, 80(3) : 271-279.
• Tillon L., Bouget C., Paillet Y. & Aulagnier S., 2016. How does deadwood structure temperate forest bat assemblages ? Eur. J. For. Res., 135(3) : 433-449.